新生兒心臟房間隔缺損5mm有一定自愈的可能，可以暫時觀察，如果到兩歲以后沒有恢復一般不能自愈，可以等到年齡較大時通過介入或者手術治療。具體情況分析如下：

　　新生兒心臟房間隔缺損發(fā)生以后，由于心房水平的分流壓差會比較小，所以自愈的可能性會比較大。新生兒心臟房間缺損在5mm左右，一般說明缺損面積較小，有一定幾率可以自愈，患者可以暫時觀察，不用過于擔心。如果新生兒到兩歲左右，房間隔缺損的現象沒有改善，則自愈的幾率會很小，此時可以在患者能夠耐受手術的時候通過手術，或者介入等方法進行治療，達到臨床治愈的目的。

　　如果新生兒心臟房間隔缺損的面積比較大，尤其是1cm以上，一般自愈的幾率極低，可能會導致新生兒出現心臟功能不好的現象，需要盡早手術治療。